Package org.biojava.nbio.phosphosite
Class Site
- java.lang.Object
-
- org.biojava.nbio.phosphosite.Site
-
public class Site extends java.lang.Object
Created by ap3 on 31/10/2014.
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Constructor Summary
Constructors Constructor Description Site()
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Method Summary
All Methods Static Methods Instance Methods Concrete Methods Modifier and Type Method Description java.lang.String
getChrLoc()
java.lang.String
getGeneSymb()
java.lang.String
getGroup()
java.lang.String
getModType()
java.lang.String
getOrganism()
java.lang.String
getProtein()
java.lang.String
getResidue()
java.lang.String
getUniprot()
static java.util.List<Site>
parseSites(java.io.File f)
void
setChrLoc(java.lang.String chrLoc)
void
setGeneSymb(java.lang.String geneSymb)
void
setGroup(java.lang.String group)
void
setModType(java.lang.String modType)
void
setOrganism(java.lang.String organism)
void
setProtein(java.lang.String protein)
void
setResidue(java.lang.String residue)
void
setUniprot(java.lang.String uniprot)
java.lang.String
toString()
-
-
-
Method Detail
-
parseSites
public static java.util.List<Site> parseSites(java.io.File f) throws java.io.IOException
- Throws:
java.io.IOException
-
getProtein
public java.lang.String getProtein()
-
setProtein
public void setProtein(java.lang.String protein)
-
getUniprot
public java.lang.String getUniprot()
-
setUniprot
public void setUniprot(java.lang.String uniprot)
-
getGeneSymb
public java.lang.String getGeneSymb()
-
setGeneSymb
public void setGeneSymb(java.lang.String geneSymb)
-
getChrLoc
public java.lang.String getChrLoc()
-
setChrLoc
public void setChrLoc(java.lang.String chrLoc)
-
getModType
public java.lang.String getModType()
-
setModType
public void setModType(java.lang.String modType)
-
getResidue
public java.lang.String getResidue()
-
setResidue
public void setResidue(java.lang.String residue)
-
getGroup
public java.lang.String getGroup()
-
setGroup
public void setGroup(java.lang.String group)
-
getOrganism
public java.lang.String getOrganism()
-
setOrganism
public void setOrganism(java.lang.String organism)
-
toString
public java.lang.String toString()
- Overrides:
toString
in classjava.lang.Object
-
-